FPGA采集不到信号求助

我采用sparten6芯片采集一路数字信号，信号连接到FPGA的一个IO口上，当FPGA里没有烧写任何程序的时候该IO口可以用逻辑分析仪测到信号，但当FPGA里烧写程序的时候该IO口就测不到信号了，请问这是什么原因?

信号速率是多少?fpga内部的系统时钟是多少啊?

学习一下学习一下

好好查查你的UCF，改管脚是定义为input了吗