关于FPGA中FFT和IFFT的问题

我在FPGA中做了一个将信号（试验中用的单音信号）先做FFT再将FFT的数据做一次IFFT，我觉得最后得到的信号应该和原信号一样；但实际操作中发现若FFT输入正交的实部和虚部（分别输入sine和cosine信号），最终ifft输出的信号实部和虚部都和原信号一致，幅度频率均正常；
若是FFT做输入实部而虚部赋值全零，最终ifft输出的信号实部和虚部仍是正交关系且频率正确，但幅度会出现周期性起伏并且起伏很大，就像带了幅度调制一样。
因为我实际输入信号也只是一个实信号，有哪位大神知道幅度起伏问题出在哪里不?

请问你用的哪个版本的FFT IP Core。我现在用Vivado2013.4中的FFT（AXIS），实部、虚部分别正弦、余弦，FFT的输出结果都不对。可以交流下不?

然后我用ISE14.7版本的FFT（8.0版本）结果就是对的。