请教FPGA debug时出现的一个问题

FPGA监视一个子卡的状态：
因为子卡上的光口没有连接，这样不管子卡是否插入系统，检测到的loss状态都应该为’1’。但是在debug的时候发现，FPGA download之后，查询该状态寄存器，发现其有多次跳变。而当FPGA稳定工作之后，子卡随便插拔，状态都不会改变（always ‘1’）。异常case只发生在FPGA被重新download之后。
请教各位这个问题可能是什么原因引起的?有没有碰到过类似的问题，如何解决的?给我点建议吧，多谢了！