allegro负片可以使用到表面层吗？

可以，但不推荐，表层用负片的话蚀刻时很难做补偿，可能还是要转成正片的处理方式

目前台弯等一些技术好的厂家，表面层都是用负片制作工艺了。
厂家会跟据它的生厂能力把你的Gerber文件转换成它要的正片换负片。
设计上看你自己的需要。正片能很好的反应实际情况，如铜皮跟VIA的间距。但铜皮用正片，电脑反应会变慢。