问一个文件系统的问题

flash通过SPI，I2C，或者SDIO接口，可以连接到CPU上面
CPU通过这些接口对flash进行访问，读写
如果是对于PC机，带有操作系统，flash肯定会被格式化，指定文件系统，然后才可以将文件保存到flash里面
但是如果是embeded的，又会是怎样的呢？
特别是不带操作系统的情况下，flash会被格式化么？会有文件系统的概念么？
文件系统到底起一个什么样的作用？

一般的Embeded OS都带文件系统，没有的话也可以自己写一个——我还用纯FPGA实现过一个简单的FAT文件系统