基于LabVIEW的显微荧光光谱成像系统
界面如图4:
图4 Fluorcell#2的光谱图像采集
完成图像立方体采集后,选择任意波长图像上感兴趣的一个区域,然后通过计算,以该区域上每个像素点的强度中值或平均值为纵坐标,波长值为横坐标,便绘制出了光谱曲线,也称为“面域光谱”,如上图中右下角曲线中的白点。所选定的区域还会被标记在系统的显示面板上。
此外,考虑到图像立方体中图像的个数有限,容易造成曲线的不平滑。所以,我们对光谱曲线进行拟合,采用三次样条内插的方法,使整个曲线看起来更加平滑。如图中右下方的曲线中红线。
除光谱曲线绘制的功能外,软件还增加了一些基本的图像处理功能,用来针对图像立方体中某一幅图像进行处理。主要有以下功能:彩色图像显示,RGB直方图,RGB阈值分割,灰度图显示,三维图,反相图,图像增强(图像均衡化,低通滤波,高斯滤波,平滑滤波),边缘锐化(拉普拉斯),灰度直方图,灰度阈值滤波,面积计算与统计,直线强度分布图。此外,为了方便对图像立方体中图像的整体了解,本系统设置了图像的Flash显示。即,按照一定的时间间隔,顺序显示多光谱图像。从效果来看,类似动画播放,使观察者对图像上目标的动态信息变化有更好地了解。这种方法同样可以应用于细胞形态变化的观察。
应用实验
1.栀子提取物抗病毒性研究
中药栀子性味苦寒、归心肺三焦经,能泻火除烦、清热利尿、凉血解毒,具通泻三焦火邪的功效,是中医药用于治疗温毒疫病的要药。病毒感染特性:病毒的感染有赖于病毒吸附蛋白(virus attachment protein,VAP )对细胞表面受体的吸附。病毒吸附蛋白是启动病毒与宿主细胞之间相互作用、建立感染损伤细胞的必然途径。
病毒与细胞受体的结合可以用荧光标记,将培养的人喉癌上皮传代细胞Hep-2和病毒作用分为三组:
(1)实验对照组y1,只加病毒,不加药
(2)先吸附,后加药组y2
(3)先加药,后吸附组y3
每组按照时间间隔2秒采集图像,得到各组的时间序列图像组,并利用荧光光谱分析系统对图像组进行分析:
1.首先以两秒为时间间隔,分别对三组细胞图像进行采集,各采10幅图。
2.然后对采集来的图像进行均衡化,平滑滤波以及高斯滤波。
3.在滤波后的图像上选择目标区域,并将所选区域以及该区域对应的原始图像区域进行显示与保存。
4.对图像进行阈值滤波,以减去细胞外的背景信息。
5.求得阈值滤波后细胞的像素面积。
6.分别比较三种情况下细胞面积的变化。
图5 Hep-2细胞抗病毒显微光谱分析
如图5所示,可以发现细胞在只加入病毒,和同时加入病毒和药物两种情况下变化趋势是不同的。前者,细胞在形态上没有明显的变化,而后者细胞在形态上都存在较大变化,呈变大的趋势。因此,可以认定加入栀子提取物对病毒的抑制作用很明显。
2.茶叶荧光性绿斑病的研究
在日照、临沂和泰安等地、市的茶园中,普遍发生一种茶树成叶病害,其主要症状表现为:叶片下表皮局部异常凸起,呈绿色,而且病斑处在光照下能发绿色荧光,如图6所示。
图6 茶叶的绿斑病
通过对病害症状演化的系统观测发现:此病害具有发绿色荧光的特性,且随病害程度的加重,荧光增强,容易与其它一般病害的症状区分开来。所以,掌握和利用这一特性可以帮助我们正确辨认此种病害。我们选定其中一病变区域的荧光测定光谱如图7。
图7 病变区荧光光谱
总结
显微荧光光谱成像技术是显微光谱成像技术中一种常用的方法,对于能够产生自体荧光和激发荧光的物质来说,显微荧光光谱成像技术具有显著的优势,包括无创性,可视性,精确性等特点。
本文基于LabVIEW软件构建的显微荧光光谱分析系统,实现了数字图像采集、图像处理及生物医学中光谱图像分析等功能。系统功能结构复杂,所有工作在一年时间内完成,相比MSDN来说,大大节约了开发时间,且界面清洁美观、操作方便。
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