求教:PADS元件交换后,为什么走线没有保持原来的走线？

昨天遇到个问题:一个LAYOUT好的PCB文件,检查有错误,可以忽略的,但是看着就是不爽,原因是做封装的时候用的是几个小的过孔来做一个大的过孔,重新把小的过孔删除了,直接重做一个大的孔就可以,问题又有一新的产生了,问题是这样的:保存退出,在板子上调用新的元件和板子上的元件交换,走线怎么没有保持原来的走线呢?不想重新走线,有什么好的办法的吗?或者在原来的封装上把小的过孔删除?