电路板的LC滤波设置不对，求大神指点怎么计算LC参数

电路板上的LC滤波器为两个L：3.5e-3H，电容C：1e-6F，截止频率为2kHz，输出波形如下所示：
后来并联20e-6F的电容，截止频率为400HZ左右，输出波形如下图所示：
波峰和波谷都发生了凹陷，这又是什么原因?希望各位懂的大神们给指点下，谢谢