CyloneIII AS模式下载成功，但程序不运行。求大神帮帮忙分析下原因！

下载完成后，断电，拔掉下载电缆，重上电，程序不运行。另外JTAG模式配置成功，程序运行正常。
测量CONFIG_DONE引脚一直为低电平；nConfig引脚一直为高电平；nStatus引脚信号为周期信号，先是一段低电平，然后是1us左右的高电平。DCLK时钟也为周期性信号，先是一段低电平，然后是1us左右的32MHz脉冲信号。
另外JIC文件也试了，显示下载成功，但数据依然加载不了。
软件用的是QuartusII 9.0，配置芯片为EPCS16，电路板是公司同事做的，并非开发板。希望有经验大神帮帮忙看看是什么原因。

使用jtag固话试试。

试过了，通过JTAG接口下载JIC文件，软件显示下载成功，但程序还是不运行。

我也遇到同样的情况，求解，谢谢！