IDT的TSI721系统无法识别

最近一个项目上需要完成X4的PCIE转RapidIO，调试结果在PCE-5126主板系统上无法找到！
TSI721工作在不同模式下现象也不一样！
1.TSI721工作在Common 模式下，PCIe时钟用PCE-5126输出的时钟（100MHz），RapidIO时钟用晶振输出的时钟（156.25MHz）。
结果PCE-5126主板无法进入系统，貌似是系统外设自检没通过。
2.TSI721工作在Non-Common模式下，PCIe与RapidIO时钟都用晶振产生的时钟（156.25MHz）。
PCE-5126主板能进入系统，但是在系统上还是看不到设备TSI721。
TSI721配置见下图

时钟输入电路1

时钟输入2