求助STM32输出问题

哪位大神帮我分析下：
    用STM32输出一个占空比频率都可以调的方波，是通过上位机控制的。我在电脑上用串口通信助手发控制信号，输出方波很稳定。但我连接到设备上去之后，输出的方波很不稳定。请教下：怎么才能弄稳定，另没有使用的IO口我都是悬空的，跟这个有关系吗?