请问如何检测两个频率相同的波形的相位差？

难道没人知道?

你所说的是正弦波么，如果是的话，请参考如下公式：
2 * sin(x) * sin(x+a) = cos(-a) - cos(2x + a)
取足够多项的取平均的话，cos(2x + a)就为0了，这时平均值就是cos(a)了。

好象用相互关滤波可以做，但我也不清楚，有做过，讨论一下。

应该是地与PWM1吧。

接地和pwm1，这个我以前做过

不管高有效还是低有效,应该都是接地吧