通过MDC和MDIO进行寄存器配置的问题

最近在使用DP83849实现百兆以太网通讯。上电后1s后进行100ms硬件复位，但是在通讯过程中，发现同一版程序，有时能正常通讯，而有时只在FPGA程序中加了个在线观测，就不能正常通讯了。在正常通讯时，A口和B口的灯都正常亮。不能通讯时，A口 SPEED灯亮，LINK和ACT灯灭，B口相反，SPPED灭，LINK和ACT灯亮。

读取了BMCR值，A口X“3100”，B口X“2100”。读取了BMSR值，A口X“786D”，B口X“784D”。

通过BMCR分析A口支持自协商，而B口为固定100M，全双工。所以希望通过软件实现对B口配置自协商，当对B口进行00h地址写入时，其他位都可以更改，唯独第9位，第12位不能被更改，一直为0。这两位也就是自协商相关功能位，因此，这种方式配置自协商失败。

我的问题是，
1. 硬件配置信息是通过BMCR和BMSR的值来判断么？如果硬件没有配置成A和B都是自协商，怎样通过管理接口进行软配置，配置后需要软复位BMCR（15）来使配置生效么。（因为在我的试验中，发现软复位后，寄存器里的值都变成缺省值了）

2.能发出去，不能接回来，是跟PHY芯片A口，B口配置信息不同导致的么（硬件上一样处理，但读回来BMCR不同）？

问题补充：

芯片 DP83849

PHY接口：Altera FPGA 环境Quartus 11.1

你好，

  你可以使用附件的Integrity Utility工具来检查DP83849的连接以及寄存器的问题，工具的使用指南可以参考附件的AN-1508 DP83849 Cable Diagnostics，谢谢！

6082.Integrity Utility.zip

5153.AN-1508 DP83849 Cable Diagnostics.pdf

谢谢您的答复，下载安装了诊断套件，看过说明书之后，发现没有介绍怎样实现电脑和PHY芯片的连接。

请问是通过PHY芯片JTAG口与PC进行连接的么，中间使用什么连接线呢，是专用连接器么。

如果不是的话，是通过什么方式连接，是否有文档。谢谢。