用Labview做算法是不是不太合适？

   遗传算法之类的优化算法～
    Matlab已经有很成熟的工具箱了～  
  不过俺喜欢拿线粘来粘去的编程，呵呵
                        有人做过吗？

8.2的mathscript支持.m文件

还没用过8.2。
但之前的版本不是可以调用Matlab吗？
二者有什么区别？

据说不需要matlab也能直接运行类似的意思

好像不行。

一般的m算法应该没啥问题，但是要用到具体工具箱的话可能不行吧
可以尝试看看调用dll的方式

是比较麻烦，图形化编程的弱点之一就是遇到数学和逻辑需求复杂的时候往往看起来眼晕……可以用C编写函数放到dll里面供labview调用，这样灵活性和可读性都可以照顾到。